אפשרי לייצא ממערכת פייפר קבצים במבנה אחדים, ו/או קבצים במבנה גמיש המאפשר להסתנכרן בקלות עם כל מערכות החשבונות המוכרות בישראל.
ניתן גם לבצע הנהלת חשבונות חד צידית ודו צידית עבור עוסקים מורשים וחברות ישירות בתוך המערכת.